1ms마다 하드를 억세스 한다면 CPU보다는 하드를 SCSI 버퍼 8M이상으로 하는게 더 성능향상 효과가 있을 것 같습니다. CPU는 일단 클럭이 빠른게 좋은거야 당연한 것이고, 분기가 자주 일어나지 않는다면 실클럭이 높은 인텔쪽이, 자주 일어난다면 AMD쪽이 좋을텐데.. MATLAB이 딱 어느쪽에 해당된다고 하기엔 좀 애매하네요. 듀얼로 꾸밀경우엔, 응용프로그램이 그에 맞게 최적화 되어야 효과가 크고 그렇지 않고 일반적인 용도엔 20%이하의 향상효과만 있다고들 하는데, MATLAB은 해당안될테니(잘은 모르겠네요) 듀얼로 꾸며서 들어갈 비용으로 차라리 더 빠른 CPU를 장착하는게 나아 보입니다만...